José Carlos Caldeira é administrador do INESC TEC e do PRODUTECH – Pólo das Tecnologias de Produção. Entre outubro de 2014 e janeiro de 2018, foi Presidente da ANI – Agência Nacional de Inovação. Até 2014, foi Administrador Executivo do PRODUTECH e Director do INESC Porto. É ainda membro do High Level Group da Plataforma Tecnológica MANUFUTURE e Chairman do seu Implementation Support Group. É membro do Board da EFFRA – European Factories of the Future Research Organization. É perito RIS3 da DG REGIO e do JRC.

É professor associado convidado da Faculdade de Economia da Universidade do Porto e da Faculdade de Ciências Sociais e Humanas da Universidade Nova de Lisboa.